Abstract A new species of smooth clam shrimp (Branchiopoda: Laevicaudata) from Mongolia and China is described here based on both morphological and genetic differences. The new species, Lynceus grossipedia n. sp., has unique features, including asymmetrically modified male thoracopods (left side thoracopods III-VI), male claspers “movable finger” (=endopod) with delicate setation, and broad, bicarinate male and female rostrum. Lynceus grossipedia n. sp. is compared with the genera Paralimnetis Gurney, 1931 and Lynceiopsis Daday, 1912 and a recently described Lynceus Müller, 1776 from China, also showing modified male thoracopods. Lynceus mandsuricus Daday, 1927 is declared nomen inquirendum. DNA barcoding has not previously been applied on smooth clam shrimp taxonomy, so we generated new cytochrome c oxidase (COX1) data for 10 Lynceus species in order to explore its usefulness for Laevicaudata. Previous Laevicaudata sequences in GenBank were scarce (~50) and biased, with 62% (n=31) being assigned to a single taxon (i.e., Lynceus macleayanus) and 28% (n=14) not assigned to species. Based on the addition of new barcoding data and the comparison with GenBank data for other clam shrimps, we conclude that distance thresholds between species (=barcoding gap) are similar for all three suborders (Spinicaudata, Cyclestherida, and Laevicaudata).

Background: Molecular epidemiology is a new scientific discipline which allows to integrate information on the genetic variation of infectious pathogens with their diffusion in a population and its subgroups including, for instance, resistance mutations to antibiotics and antiretrovirals. We present the results of an analysis of scientific publications that analyze the health status of the immigrant population in Spain from a molecular epidemiology perspective. Methods: We reviewed original articles published in 1998-2014 with the keywords "molecular epidemiology", "molecular typing", "sequencing", "immigrant", and "Spain". Results: From a total of 267 articles identified initially, only 50 passed through the established filters. Most of them (36) analyzed infections by Mycobacterium tuberculosis (3) and HIV (3), followed at a large distance by Staphylococcus aureus and hepatitis B virus. The main goal of these works was the typing of the pathogen and to determine the frequency of resistance mutations. Conclusion: Is difficult to generalize the conclusions from the analyzed articles because most of them have a purely descriptive and quite restricted scope, considering the type and size of the samples studied. Several studies are focused on the most likely origin for the strains or variants of the pathogen but others also reveal transmissions from the local to the immigrant populations.

Fundamentos: La epidemiología molecular es una nueva disciplina que permite la integración de la información sobre la variabilidad genética de patógenos infecciosos con su difusión en la población y subgrupos de la misma incluyendo, por ejemplo, las mutaciones de resistencia a antibióticos y antivirales. El objetivo es conocer qué posibles diferencias existe en las características genéticas de los agentes infecciosos que afectan a las poblaciones inmigrante y autóctoctona en España. Métodos: Se revisaron artículos originales publicados entre 1998-2013, con las palabras clave "epidemiología molecular", "tipado molecular", "secuenciación", "inmigrante", "España". Resultados: De un total de 267 artículos identificados inicialmente, 50 pasaron los diferentes filtros establecidos. De ellos, 36 analizan las infecciones por Mycobacterium tuberculosis y VIH, seguidos de los que analizan infecciones por Staphylococcus aureus (3) y el Virus de la Hepatitis B (3). Conclusiones: Los objetivos principales de estos trabajos fueron el tipado del patógeno y la determinación de la frecuencia de mutaciones de resistencia. Los estudios más frecuentes correspondieron a cohortes retrospectivas, seguidos por los estudios ecológicos y los ensayos clínicos. En general los estudios son descriptivos y su ámbito por el tipo y tamaño de muestra es bastante restringido. En varios se determina que las cepas o variantes del patógeno encontradas en inmigrantes tienen su origen más probable en sus países de origen, si bien otros también ponen de manifiesto la transmisión desde la población autóctona a la inmigrante.

Background: Molecular epidemiology is a new scientific discipline which allows to integrate information on the genetic variation of infectious pathogens with their diffusion in a population and its subgroups including, for instance, resistance mutations to antibiotics and antiretrovirals. We present the results of an analysis of scientific publications that analyze the health status of the immigrant population in Spain from a molecular epidemiology perspective. Methods: We reviewed original articles published in 1998-2014 with the keywords "molecular epidemiology", "molecular typing", "sequencing", "immigrant", and "Spain". Results: From a total of 267 articles identified initially, only 50 passed through the established filters. Most of them (36) analyzed infections by Mycobacterium tuberculosis (3) and HIV (3), followed at a large distance by Staphylococcus aureus and hepatitis B virus. The main goal of these works was the typing of the pathogen and to determine the frequency of resistance mutations. Conclusion: Is difficult to generalize the conclusions from the analyzed articles because most of them have a purely descriptive and quite restricted scope, considering the type and size of the samples studied. Several studies are focused on the most likely origin for the strains or variants of the pathogen but others also reveal transmissions from the local to the immigrant populations.

Fundamentos: La epidemiología molecular es una nueva disciplina que permite la integración de la información sobre la variabilidad genética de patógenos infecciosos con su difusión en la población y subgrupos de la misma incluyendo, por ejemplo, las mutaciones de resistencia a antibióticos y antivirales. El objetivo es conocer qué posibles diferencias existe en las características genéticas de los agentes infecciosos que afectan a las poblaciones inmigrante y autóctoctona en España. Métodos: Se revisaron artículos originales publicados entre 1998-2013, con las palabras clave "epidemiología molecular", "tipado molecular", "secuenciación", "inmigrante", "España". Resultados: De un total de 267 artículos identificados inicialmente, 50 pasaron los diferentes filtros establecidos. De ellos, 36 analizan las infecciones por Mycobacterium tuberculosis y VIH, seguidos de los que analizan infecciones por Staphylococcus aureus (3) y el Virus de la Hepatitis B (3). Conclusiones: Los objetivos principales de estos trabajos fueron el tipado del patógeno y la determinación de la frecuencia de mutaciones de resistencia. Los estudios más frecuentes correspondieron a cohortes retrospectivas, seguidos por los estudios ecológicos y los ensayos clínicos. En general los estudios son descriptivos y su ámbito por el tipo y tamaño de muestra es bastante restringido. En varios se determina que las cepas o variantes del patógeno encontradas en inmigrantes tienen su origen más probable en sus países de origen, si bien otros también ponen de manifiesto la transmisión desde la población autóctona a la inmigrante.